Najczęstszymi przyczynami niepłodności u kobiet są:

• nieregularne miesiączki – prawidłowy cykl menstruacyjny powinien trwać od 21 do 35 dni. Jest raz jest on dłuższy, a raz krótszy i kobieta nie jest w stanie określić przybliżonej daty krwawienia, można już mówić o nieregularności, której podłoże należy zbadać;
• nieprawidłowa gospodarka hormonalna
• najczęściej wiąże się ona z chorobami tarczycy, zespołem policystycznych jajników (PCOS) lub zaburzeniami fazy lutealnej;
• bolesne miesiączki/bolesne współżycie – tego rodzaju przypadłości mogą świadczyć o stanach zapalnych bądź endometriozie;
• endometrioza – to choroba hormonalno-immunologiczna wiążąca się z rozrostem błony śluzowej jamy macicy i jej obecnością w obrębie jamy brzusznej;
• mięśniaki macicy – to najczęstszy niezłośliwy nowotwór macicy, który występuje u 20-50% kobiet w wieku rozrodczym i pomenopauzalnym;
• nieprawidłowości jajowodów – stanowią fizyczną przeszkodę na drodze połączenia komórki jajowej z plemnikiem;
• infekcje w obrębie narządów moczowo-płciowych;
• nieprawidłowości w budowie macicy – np. dwurożność, przegroda, łukowatość;
• wiek – po 35. roku życia możliwość zajścia w ciążę maleje gwałtownie. Dojrzałe ciąże obarczone są również większym ryzykiem (wystąpieniem powikłań czy rozwojem wad genetycznych u dziecka);
• wrogość śluzu szyjkowego – śluz zwalcza i neutralizuje plemniki;
• niewłaściwa masa ciała – w tym przypadku problemem może być zarówno niedowaga, jak i otyłość;
• przyjmowanie używek – nadużywanie alkoholu, palenie papierosów bądź zażywanie narkotyków;
• choroby metaboliczne – wywierają one wpływ na cały organizm, w tym również na płodność;
• zaburzenia układu odpornościowego;
• hiperprolaktynemia – nadmiernie podwyższony poziom prolaktyny także może być przyczyną problemów z poczęciem dziecka

Najczęstszymi przyczynami niepłodności u mężczyzn są:

• nieprawidłowe parametry nasienia – zbyt mała liczba plemników, ich nieprawidłowa ruchliwość lub morfologia, a także objętość ejakulatu. Tego rodzaju problemy z płodnością zwykle znacznie łatwiej jest zdiagnozować i wyleczyć niż niepłodność kobiet;
• nieprawidłowy styl życia – przewlekły stres, nadużywanie alkoholu, palenie papierosów, siedzący tryb życia, dieta uboga w antyoksydanty, cynk i selen;
• przewlekłe stosowanie niektórych leków;
• urazy lub wrodzone wady jąder;
• długotrwałe przegrzewanie jąder;
• wrodzona lub nabyta niedrożność nasieniowodów;
• zaburzenia wzwodu i ejakulacji (ejakulacja wsteczna) – podczas wytrysku może dochodzić do wstecznego wypływu nasienia do pęcherza moczowego;
• żylaki powrózka nasiennego – charakteryzują się zbieraniem krwi w poszerzonych żyłach, nieleczone mogą stać się poważną przeszkodą na drodze do rodzicielstw;
• infekcje – zakażenia bakteryjny lub grzybicze również negatywnie odbijają się na liczbie oraz jakości produkowanych przez jądra plemników;
• choroby autoimmunizacyjne – system odpornościowy może wówczas traktować plemniki jako ciała obce i wytwarzać przeciwciała, które ja zwalczają;
• nieprawidłowa gospodarka hormonalna
• nieprawidłowe funkcjonowanie narządów lub gruczołów produkujących hormony płciowe;
• operacje przepukliny pachwinowej lub okolic krocza i jamy brzusznej.