Histeroskopia wykonywana jest w znieczuleniu ogólnym, w związku z tym pacjentka musi być na czczo minimum 6 godzin przed wykonaniem zabiegu. Odpowiednim momentem do wykonania histeroskopii jest czas po ustaniu krwawienia miesiączkowego. Sam zabieg trwa kilkanaście minut i polega na wprowadzeniu endoskopu przez pochwę do macicy. Zmiany chorobowe usuwa się za pomocą elektrosekcji lub lasera. 

Zabieg zazwyczaj poprzedza zlecona kuracja hormonalna, której celem jest zmniejszenie grubości ścian macicy oraz wielkości mięśniaków. Pochwa powinna być wyczyszczona z bakterii dzięki stosowaniu globulek dopochwowych.